A doença Chagas causada pelo Trypanosoma cruzi e as leishmanioses ocasionadas por diferentes espécies do gênero Leishmania, são doenças tropicais negligenciadas. Possuem grande importância médica e social, afetam milhões de seres humanos, não possuem medicações eficientes e suas formas de controle não têm sido eficazes para cessar suas transmissões. Dessa forma, é importante o desenvolvimento de vacinas para contribuir com o controle dessas doenças, fato que é dificultado pela enorme variabilidade genotípica e fenotípica destes organismos, mesmo em nível intraespecífico. Tendo desenvolvido estratégias de expressão de uma quimera protéica constituída por diferentes epítopos antigênicos por dois tripanosomatídeo não patogênicos (T. rangeli e L. tarentolae) e considerando a impossibilidade de progressão de ensaios experimentais frente a pandemia por SARS-CoV-2, propomos neste projeto realizar análises in silico quanto à representatividade e variabilidade dos epítopos contidos na quimera protéica em cepas de tripanosomatídeos isolados de humanos, animais silvestres e vetores no Estado de SC (T. rangeli e L. infantum), utilizando os genomas recentemente sequenciados pelo nosso grupo. A partir de análises de similaridades através de BLASTp, observamos que os fragmentos proteicos imunogênicos contidos na sequência quimérica estão presentes nas sequências proteicas das cepas de L. infantum e de T. rangeli circulantes em Santa Catarina, possuindo em sua maioria uma identidade de 100%. Isto sugere que é possível usar a quimérica proteica para a elaboração de uma vacina para a região de Santa Catarina. Com base nestes resultados, as análises de SNP e a reconstrução filogenética não foram realizadas pois não seriam informativas.