Para adequada resposta à seleção genômica, torna-senecessário obter grande quantidade de animais genotipados com muitos SNPs,e a utilização de todos os animais da população genotipados com painéis dealta densidade ainda exige custo elevado. Dessa maneira, genotipar animaiscandidatos jovens com painéis de menor custo, como os de baixa densidade e,então realizar a imputação dos marcadores não conhecidos utilizando ainformação de uma população referência genotipada com painéis de altadensidade, tornou-se uma alternativa para redução de custos para aplicaçãodesta tecnologia. Atualmente existem dois painéis de alta densidade de SNPsdisponíveis comercialmente para bovinos: o BovineHD BeadChip (Illumina Inc.,San Diego, CA) e o Axion Genome-Wide BOS 1 Array Plate (Affymetrix, Inc.).Dessa maneira, o objetivo deste estudo foi verificar a acurácia de imputaçãoutilizando diferentes cenários para os painéis de alta densidade. Foramutilizados 801 animais Nelore e 10 diferentes cenários (Tabela 1), em que apopulação de animais referência é a população de animais que foram mantidostodos os SNPs do painel de alta densidade. Os demais animais da populaçãotiveram seus SNPs “escondidos” com a finalidade de mimetizar que estesanimais foram genotipados com painéis comerciais de baixa densidadecontendo 20 mil SNPs (20k) ou 50 mil SNPs (50k). Quando os touros foramconsiderados na população referência observou-se maiores resultados deacurácias. Ao comparar a densidade dos painéis utilizados, nota-se que aacurácia foi maior quando os cenários são de 50k para 600k, indicando que amaior densidade dos painéis imputados auxilia na imputação. O tamanho dapopulação referência maior (100 animais), resultaram maior acurácia. Por fim,ao comparar o painel Affymetrix com o Illumina, nota-se que os cenários com oIllumina a acurácia foi maior, mesmo tendo maior quantidade de SNPs para serimputado. Este resultado pode ter sido observado devido ao modo como opainel é construído.