A água é um elemento essencial, mas este recurso pode atuar como um veículo para microrganismos capazes de causar prejuízos à saúde, quando em condições precárias de saneamento. Quando há contaminantes na água está diretamente ligado à disseminação de microrganismos resistentes. O objetivo desse trabalho foi avaliar a qualidade microbiológica de rios e poços em Curitibanos-SC, determinar o perfil de resistência em isolados de E. coli. Os rios abrangidos no estudo foram o Rio Marombas, Correntes, Canoas e Pessegueirinho, e poços adjacentes aos mesmos. Para as análises de número mais provável (NMP) de coliformes, foi utilizado o método de tubos múltiplos através do teste presuntivo e teste de coliformes fecais. Foi isolado colônias de E.coli e analisadas a susceptibilidade a antibióticos por meio do método de difusão por discos com a utilização dos antimicrobianos. Os resultados revelam que para coliformes em rios não houve diferenças significativas entre estações, o número mais provável foi de 631^.100mL^-1, os valores físico-químicas estão dentro do estabelecidos. Com relação a resistência a antimicrobianos, os isolados possuíram 75% de resistência para Ampicilina no inverno, e para Ampicilina+Sulbactam no verão, para a Cefazolina, Ciprofloxacina e Tetraciclina não tiveram diferença significativa entre a época do ano. Os poços adjacentes ao Rio Canoas e Pessegueirinho apresentaram maior número de coliformes. Os isolados apresentaram maior resistência a Ampicilina durante o verão, para Ampicilina+Sulbactam no verão e inverno. A utilização destes recursos sem tratamento prévio representa riscos para a saúde dos consumidores, além de ser um risco ambiental, devido à difusão de microrganismos resistentes pelo ambiente, o que demonstra a necessidade da adoção de políticas de tratamento da água, visando a preservação dos recursos hídricos em Curitibanos.