Introdução: A deficiência auditiva na infância está entre as doenças passíveis de triagem ao nascimento, destaca-se, que o Brasil apresenta incidência de  30:10.000 nascidos vivos. Entre os Indicadores de Risco para Deficiência Auditiva (IRDA) estão as infecções congênitas.

Objetivo: Verificar a frequência de Toxoplasmose, Rubéola, Citomegalovírus, Sífilis e Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) em neonatos e suas possíveis associações com resultados da Triagem Auditiva  Neonatal (TANU), além de avaliar um serviço de referência em TANU para o SUS segundo indicadores de qualidade internacionais.

Métodos: Estudo de coorte histórica (retrospectivo) com análise dos dados de neonatos atendidos em um serviço de referência em Saúde Auditiva para o Sistema Único de Saúde (SUS), no período de janeiro de 2017 a dezembro de 2021.

Resultados: Verificou-se que 351 (1,7%) neonatos falharam na TANU e 363 (1,7%) apresentavam sífilis congênita. Com  relação à idade materna, houve maior frequência (53,5%) de mães com idades entre 20 e  29 anos na amostra. Na análise ajustada, neonatos com sífilis congênita apresentaram  3,25 vezes mais chance de falhar na TANU, quando comparados  aos neonatos sem sífilis congênita.  Infecções congênitas estavam presentes em 956  neonatos (2,75%). A infecção congênita em neonatos, a sífilis  congênita foi a mais frequente (1,59%), seguida pelo HIV (0,87%) e a de menor  observação foi a rubéola (0,029%). No ano de 2021 os neonatos com possível  transmissão vertical do HIV, apresentam seis vezes mais chances (entre 388 a 1.143%  mais chances de falhar no TANU.

Conclusão: O serviço de referência de TANU alcançou a cobertura de triagem. Os casos de infecções congênitas apresentaram índices decrescentes e podem estar associados ao aumento das  medidas de prevenção Os dados apresentados poderão fornecer subsídios para a reflexão sobre a atuação dos profissionais de saúde na atenção à saúde, para a promoção da integralidade do cuidado da população infantil.