Desde aditivos alimentares à questões de saúde, o monitoramento de sulfato, sulfeto e sulfito é de vital importância para a sociedade, bem como o desenvolvimento de um método capaz de monitorar simultaneamente estes analitos. Uma técnica analítica com potencial para ser empregada no desenvolvimento de tal método, é a Eletroforese Capilar de Zona (CZE). Essa técnica se destaca pela sua consonância com a química verde, devido ao uso de pequenas quantidades de reagentes e amostras, e consequentemente uma baixa geração de resíduo. Outro destaque da técnica é a possibilidade de desenvolvimento de métodos com frequência analítica elevada. Desta forma, o objetivo do presente trabalho foi a prospecção de um método para análise simultânea de sulfato, sulfeto e sulfito por CZE. O software PeakMaster® foi usado nas otimizações e permitiu selecionar os componentes do eletrólito de corrida ideal para a separação dos compostos-alvo. Todas as separações experimentais foram conduzidas empregando capilares de sílica fundida modificados com sal de quitosana quaternizada e instrumento de CZE com detector de arranjo de diodos. Dentre as estratégias avaliadas, a condição experimental final obtida envolveu um capilar de 48,5 cm de comprimento total, detecção indireta para o sulfato e sulfito em 210 nm e detecção direta para o sulfeto em 240 nm, voltagem de -30 kV, injeção hidrodinâmica, padrão interno ácido maleico e pH do eletrólito de corrida 7,4. Os eletroferogramas experimentais foram semelhantes aos simulados indicando que o software PeakMaster® é uma importante ferramenta na otimização do método e previsão experimental. As separações ocorreram em um tempo de menos de 4 minutos, sendo consideradas relativamente rápidas. O método proposto por CZE tem um grande potencial para ser validado e empregado na análise desses ânions para fins de controle de qualidade de amostras de alimentos ou monitoramento de amostras ambientais.