O presente estudo, visa quantificar os fluxos de água subterrânea diferentes regiões da Lagoa da Conceição. A Lagoa da Conceição é uma laguna costeira que vem sofrendo um crescimento urbano intensivo e desordenado. O conhecimento sobre as trocas de água entre o subterrâneo e o superficial de extrema importância para a compreensão do ciclo hidrológico e dos efeitos antrópicos em aquíferos, visando a proteção e recuperação do sistema. Para isso, foram confeccionados equipamentos de baixo custo para a quantificação dos fluxos subterrâneos, os seepages meters e minpiezômetros. E assim, relacionar esses dados com a pluviosidade, nível interno da Lagoa e o nível subterrâneo. . Foi identificado grande variação espacial na seção do LIC. O nível interno da laguna se manteve congruentes entre os equipamentos, não foi possível estabelecer relação direta entre a chuva e o nível da lagoa. O estudo avaliou essas características nos principais subsistemas, sul e central. Na seção do Lagoa Iate Clube (LIC) o fluxo subterrâneo se manteve neutro e com baixa intensidade, com média de 0,09 cm/dia, na Rua Servidão Kairós (KAI) a média se manteve positiva de 1,54 cm/dia, enquanto no Beco dos Coroas a intensidade se manteve próxima a da KAI, mas com sentido negativo com média igual a -1,53 cm/dia. A pesquisa e sua aplicação apresentaram dados importantes para a avaliação do papel das descargas subterrâneas sobre o escoamento na Lagoa, o método foi de fácil aplicação, não havendo grandes dificuldades durante as coletas.