A tuberculose (TB) é uma doença infecciosa e transmissível causada pela bactéria Mycobacterium tuberculosis (Mtb), que afeta primordialmente os pulmões e em alguns casos mais graves, pode ser capaz de acometer outros órgãos e sistemas. A doença é caracterizada como problema de saúde pública, pois a cada ano são notificados cerca de 70 mil casos no Brasil e 10,4 milhões de casos novos no mundo, sendo que 4,5 mil e 1,8 milhão evoluem a óbito, respectivamente. Nos últimos anos observou-se aumento de notificações de casos da doença, principalmente aqueles com isolados resistentes aos antimicrobianos. Com o advento de tecnologias de nova geração para o sequenciamento completo do genoma (WGS) das bactérias, tornou-se possível avaliar de forma mais abrangente as mutações em toda a extensão do genoma em isolados de Mtb. As descobertas de mutações em genes reconhecidamente envolvidos ou em genes não envolvidos com resistência aos fármacos abriram caminhos para maior compreensão desse fenômeno. Embora, os estudos concentrem-se em análises de mutações nos genes de resistência já descritos; o presente estudo realizou busca na literatura, do genoma completo de isolados, para grupos experimentais sensíveis e resistentes aos fármacos para o tratamento da TB. Os dados de sequenciamento foram obtidos na base de dados Sequence Read Archive do NCBI e foram submetidos a um pipeline que foi desenvolvido no Laboratório de Biologia Molecular, Microbiologia e Sorologia (LBMMS)/CCS/UFSC. O desenho do pipeline foi constituído pelos seguintes passos: obtenção dos dados em base de dados públicos utilizando a ferramenta FastQ Dump, aplicação de filtro de qualidade das sequências utilizando o FastQ Quality Filter, mapeamento do genoma de referência e anotação gênica automática pelos programas Bowtie-2 e SamTools, resultando na identificação de mutações e comparação com banco de dados de mutações de Mtb conhecidas pela combinação dos resultados das ferramentas SamTools/BCFTools, FreeBayes e GATK.