A maioria dos estudos sobre restauração ecológica avalia parâmetros acima do solo, como características do caule e folhas. Pouco se sabe, porém, sobre o que acontece abaixo do solo em processos de restauração, tampouco em locais invadidos por plantas invasoras exóticas. Sabe-se que os plantios de restauração ecológica podem ser influenciados por interações planta-planta e/ou planta-fungo, e por isso buscamos entender o papel das ectomicorrizas em uma área em restauração por retirada de espécie exótica invasora, usando a problemática da invasão por Pinus spp. no Parque Natural Municipal Dunas da Lagoa da Conceição em Florianópolis. O objetivo do presente trabalho foi avaliar o efeito do controle de Pinus spp. nas taxas de ectomicorrização em áreas de restinga. Coletamos amostras de raízes em áreas não invadidas e invadidas por Pinus spp. e uma onde as plantas de pinus foram manejadas (corte), para avaliar a taxa de ectomicorrização (% de ectomicorrizas) nas raízes das comunidades vegetais. A taxa de ectomicorrização das raízes foi de 40% na área não invadida, 43% na invadida e 27% na manejada. Tal resultado nos mostrou que a retirada da espécie invasora resultou em uma menor taxa de ectomicorrização, fato que está relacionado com o manejo efetuadona área. Nosso estudo ainda confirmou a hipótese de que as regiões neotropicais possuem ectomicorrizas nativas, quebrando o paradigma de que elas eram presentes majoritariamente nas regiões temperadas.