O glifosato é um ingrediente ativo de muitos herbicidas, mas sabe-se que ele pode ser citotóxico, levando a complicações do metabolismo celular e alterando a fisiologia mitocondrial. Neste sentido, avaliou-se a neurotoxicidade de um agroquímico contendo glifosato através da análise de autofagia, morfologia nuclear e de proteínas envolvidas no sistema antioxidante em células de linhagem de astroglioma C6 expostas por 24h a 0, 40 ou 80 μM do herbicida. As células cultivadas em lamínulas foram incubadas com anticorpos anti-ATG16L1, anti-LC3B, anti-PINK1, anti-Nrf2 ou anti-NQO1 e coradas com DAPI para análise da autofagia e da morfologia nuclear por imunofluorescência. A mensuração da atividade da enzima catalase foi avaliada através da decomposição do H2O2 por espectrofotometria. Observou-se uma indução da autofagia devido ao aumento do número de células positivas para ATG16L1 e para LC3B nas amostras expostas a 40 μM do herbicida. Ainda, as células expostas ao herbicida possuíam a morfologia nuclear alterada, com efeito dose-dependente, onde o núcleo apresentou-se mais condensado. Com relação a PINK1, não foram observadas diferenças na marcação da mesma nas células expostas ao herbicida. Por fim, não houve alterações na atividade da enzima catalase, assim como não foram observadas alterações na marcação para Nrf2 e NQO1 por imunofluorescência, nas células expostas ao herbicida. Concluiu-se que o herbicida na menor concentração utilizada neste estudo não induziu a ativação do sistema antioxidante, porém estimulou a autofagia, provavelmente a fim de remover organelas disfuncionais da célula, evitando a morte celular. No entanto, observou-se alterações na morfologia nuclear, que pode ser um indicativo de apoptose. Desta forma, mais estudos são necessários para verificar se o herbicida induz uma autofagia excessiva, o que pode desencadear o processo de morte celular, ou se está atuando como um mecanismo citoprotetor.