Esta pesquisa tem como objetivo avaliar o desempenho da eletroflotação no tratamento de águas provenientes de mananciais com grande concentração de cianobactérias. As cianobactérias são microrganismos fotossintéticos que em algumas ocasiões podem tornar um manancial inapto para a utilização para abastecimento público. As cianobactérias vêm chamando a atenção da comunidade científica, devido ao aumento de florações de algas podendo liberar toxinas nocivas aos seres humanos, sendo assim um problema no abastecimento público em diferentes partes do mundo. Para a realização desta pesquisa foi utilizado um sistema piloto composto de eletroflotação seguida por filtração rápida descendente, o sistema foi alimentado com água bruta proveniente do manancial da Lagoa do Peri. Foram realizadas três carreiras de filtração onde foram monitorados os parâmetros, cor, turbidez, ph, condutividade, temperatura e cianobactérias. O sistema apresentou pequenas remoções de cor e turbidez, e apesar do reduzido número de carreiras já foi possível observar uma boa remoção de cianobactérias, cerca de 60% após a eletroflotação.