A Doença de Chagas é uma Doença Tropical Negligenciada de alcance mundial, cujo agente etiológico consiste no protozoário Trypanosoma cruzi que é transmitido por vetores triatomíneos. A quimioterapia para o tratamento da doença é limitada e os medicamentos apresentam diversos efeitos adversos, dessa forma o presente estudo almeja investigar inibidores da enzima cruzaína através de técnicas in silico de SBDD e LBDD para o desenvolvimento de fármacos eficazes e seguros para a doença de Chagas. Nesta pesquisa, foram isoladas antocianidinas do extrato bruto de Arrabidae Chica, que é uma planta encontrada no Cerrado, Mata Atlântica e nos biomas amazônicos e que possui atividade antiparasitária contra o Trypanossoma cruzi e a Leishmania spp relatada na literatura da área. Estudos de Docking Molecular comprovaram a ativação da enzima óxido nítrico sintase através da antocianidina carajurina por meio de interações intermoleculares com as cadeias laterais dos aminoácidos de serina e arginina da enzima. Dessa forma, os resultados compilados neste trabalho podem sugerir que a carajurina seja um marcador biológico de A. chica com atividade antileishmanicida.